Japonya'da yaşayan Belçikalı bir çocuk olan Amélie, arkadaşı Nishio-san ile hayatı keşfeder. Üçüncü doğum günü, dünyayı anlama biçimini şekillendiren, hayatını değiştirecek olayların başlangıcını işaret eden bir dönüm noktası olur.